在沼氣進入沼氣水分離器之前，應設置有冷凝水罐或沼氣顆粒過濾器。沼氣水分離器可以消除沼氣中夾雜的顆粒雜質，并使得沼氣在進入脫硫前含有一定濕度。

當觀察到脫硫劑變色，或系統(tǒng)壓力損失過大時，應交替使用另一個沼氣水分離器。當前的脫硫塔在沼氣放空后，進行自然通風，對脫硫劑進行再生。當再生效果不佳時，應從塔體底部將廢棄的脫硫劑排除，在底部排放廢棄填料的同時，相同體積的新鮮脫硫填料加入反應器中。

沼氣水分離器構造說明填充料說明：

TFC系列脫硫劑是以氧化鐵為主要活性組份，添加有其他促進劑加工成型的高效凈化劑。在常溫下，對氣體中的硫化氫有很高的脫除性能，對硫醇類有機硫和大部分氮氧化物也有一定脫除效果。

TFC系列脫硫劑在使用上具有設備簡單、操作方便、凈化度高床層阻力低、實用性強，無二次污染等特點，沼氣脫硫凈化裝置即便在無氧無氨等苛刻條件下，也能精度脫除硫化氫。