水箱自潔消毒器分為內置式和外置式，（常用型號有WTS-2A ，WTS-2B，WTS-2W。SCII-5HB，SCII-10HB，SCII-20HB，ZM-2,ZM-1。）內置式也叫分體式，是有控制柜和輔機組成。控制柜安裝于水箱外面產生臭氧，輔機安裝于水箱內部起到將臭氧與水混合作用。外置式也叫做一體式，水箱留一條管道（DN25,DN32，DN40,DN50）與自潔消毒器連接，水箱內水流進自潔消毒器內經過臭氧混合消毒后留回水箱。